农业产业化经营是一个市场化的过程，在这个过程中，利益分配机制的合理化，始终是农业产业化发展的核心与要害。
　　农业产业化经营所面对的市场是一个全方位、开放性的市场体系。它不仅包括消费品市场，而且还包括生产资料市场，土地、劳动力、资金等生产要素市场。市场机制不健全，各方面的利益关系就难以理顺，这些都直接或间接影响着农业产业化的顺利推进。信息的不对称以及土地流转市场的不完备，农村融资机制的不完善等，这些都影响着农民利益的实现程度。由于农户在农业产业化经营中要承担大量的专用性资产投资，所以一旦经营失败，农户将承担较为严重的经济损失。因此，要通过改革，加快建立以资本市场、技术市场、信息市场、土地流转市场、劳动力市场为主的生产要素市场的建立和完善，同时大力发展农产品的综合批发市场、专业市场、零售市场等，形成批、零相互衔接，互为依存的农业市场体系，利用现代化的通讯技术，加快市场信息流量，促进多种生产要素的合理流动，通过生产要素
的流动带动产业结构的调整，使农业产业化经营真正进入市场调控，按市场规律优化资源配置，使农户在利益机制的市场调节中，获得社会平均利润，使其在产业化经营中的自身利益得以实现。
　　利益分配机制的合理化，是农业产业化发展的核心要求，生命力之所在。只有妥善处理好各方面的利益关系，形成合理的利益分配机制，农业产业化才能顺利进行。
　　让农民充分分享农产品加工和流通领域的利润，是推进农业产业化的根本目的所在。因此，在推进农业产业化过程中，要注重保护好农民的积极性，正确处理好公司和农户之间的利益关系。一是必须在公司和农户之间建立起规范、合理、有效的合同治理关系，提高公司和农户之间的履约率。二是努力探索资产联结、产权介入的运行机制，实现真正意义上的企业化治理。三是公司要树立长远发展的利益观，从企业自身发展的战略意义出发，切实保护好农民的利益。龙头企业要注重与农民合理分配农产品的生产、加工、销售环节的利润，真正与农户结成利益共享、风险共担的产业联结共同体。
　　龙头企业在产业化发展过程中，具有上连市场下连农户的桥梁作用，是农业产业化能否形成和发展的要害环节。现阶段必须采取多种措施，培育壮大骨干龙头企业群体，增强其辐射作用和核心竞争力。
　　一是充分调动各种资源，充分利用多种经济成分培育、发展壮大龙头企业。
　　二是通过科技创新，不断提高龙头企业发展的科技含量，增强龙头企业的核心竞争力。
　　三是建立龙头企业现代治理机制，提高企业治理水平，强化龙头企业的战略思维意识。总之，培强、做大龙头企业，可以充分提高市场竞争力，积极参与国际竞争，及时规避市场风险，使公司与农户真正从农业产业化中获得更大的利益。
　　一个产业的迅速发展，离不开高素质的从业人员。但是，农民科技、文化素质的相对低下，严重影响了农业产业化中的科技推广和农业产业化的进一步提升，同时也严重制约了农民收入的提高。因此，我们还必须紧紧抓住农业科技进步和农民素质提高这个要害，努力促进农业增长方式的根本性转变